此时，李耘生仍冒着随时被捕的危险，留在南京处理党组织遭受破坏的善后工作。在敌人严密地搜查中，他经常更换住地，巧与敌人周旋。他到贫儿院派一个进步学生连夜赶到溧阳找特支，通知党员转移，使溧阳特支免遭损失。