新中国成立后，汪猷被聘为中国科学院生理生化研究所研究员，后又调入有机化学研究所任研究员、副所长、代理所长、所长，中国科学院上海分院副院长。由于国家对科学事业的重视，更激发了他对振兴祖国科学事业的热情，他的研究生涯进入了黄金时期。