1990年 受聘为国家教委教学指导委员会委员。
1992-1993年 获王宽诚育才奖及政府特殊津贴。
1994年 出访美、法两国，建立“计算机化学”国际合作关系。
张懋森 - 主要成就
青年时期，用科学技术为人民服务
1958年初，某特殊钢厂提出，如能在10分钟内完成高速工具钢中钨的炉前分析，就可赶超技术先进国家炼制该钢的速度。张懋森组织高年级学生设计三种新法，都能在3-10分钟内完成分析。钢厂选定其中一种投产，受到欢迎。为此，湖北省委组织三次万人大会，由张懋森和另两人作报告。后来，又把他请到北京政协礼堂大会发言并在怀仁堂受到中央首长接见。1962年，“络合滴定法”在分析化学中开始受到重视，但原有理论难于应用，张懋森写出能预测实验效果的“酸效应、掩蔽效应”等论文发表，并写入全国教材《分析化学》中（1998年该书新版获国家教委科技进步一等奖）。
创立中国的“计算机化学”学科并应邀到全国各地讲学
1976年，张懋森被调到中国科技大学，次年获该校“教育革命先进工作者”奖状。张懋森和妻子文平预测，计算机必将普及，在各行各业中发挥作用，在化学领域应从我们做起。于是两人努力学习，编出教材，开设计算机化学课，招收研究生，开展研究，发表论文。1981年夏，王夔教授邀请张懋森到北京作“计算机化学”讲学，同年郭承基教授邀请他到贵阳讲学。由于学科面广，张、文夫妇两人遂分工，张侧重软件（语言、数据库、专家系统等），文侧重硬件（接口电路、仪器联机与自动化等）。此后，全国各地邀请不断，东至青岛、福州，西至呼和浩特、乌鲁木齐，南至广州、深圳，北至辽宁鞍山，由他们二人一道或分头去讲，每次课时六七天、一二天不等，绵延15年（1981年-1995年），遍及24个省、市、自治区。
创办中国的计算机化学杂志
由于学科迅速普及，各地成果涌现，原有化学杂志的口径和容量都成了问题。1983年，张、文向国家科委提出报告，要求创办《计算机化学》杂志，批复的名称定为《计算机与应用化学》，张、文分任主编和编辑部主任，后来，工作量逐年增大，他们组织了全国性的“主编委员会”，编辑部设在北京的中国科学院化学冶金研究所，该杂志已被选人中国核心期刊中。该委员会是这一学科的全国性学术领导机构，曾主办第一至六届全国计算机化学学术会议，1987年还曾主办了第八届国际计算机化学会议。1999年又组织了长春的第七届全国会议。
培养硕士博士生，建立国际合作
1978年起，“计算机化学”专业共招收硕士生60人次，博士生20人次。毕业生遍布五洲四海，有的已成为国内大学的系、室主任，正、副教授。计算机化学的研究成果已与生物、医学、冶金、考古等方面的研究结合开花结果。1994年，应国外邀请，张、文出访美国、法国，建立了合作研究关系。该室研究生在外颇受好评，如徐峻博士是美国一个大制药公司的首席科学家，李国胜博士在法国南锡大学努力工作，并带动同室的外国学生抓紧工作，法国朋友说：“李来室后，完全改变了我室的面貌”。
张懋森 - 主要论著