朱洪元为在中国建立高能物理实验基地作出重要的贡献。1972年底，中国科学院原子能研究所张文裕、朱洪元等18名科学家写信给周恩来总理，建议抓紧基础科学研究，建造中国的高能物理实验基地，此建议得到周总理的肯定及支持。1973年张文裕、朱洪元等率团考察美国各地的高能物理研究中心及瑞士的西欧研究中心（CERN），其后逐渐形成建造高能加速器的方案，最后在1983年，改定为北京正负电子对撞机方案。在这一方案的论证和制定的过程中，朱洪元起了重要作用。