6月，任中国科学院党的核心领导小组第一副组长、副院长，主持科学院的工作，认真贯彻中央全面整顿的方针，主持起草了《关于科技工作的几个问题》的汇报提纲。 9
月26日，向邓小平等作关于科学院工作《汇报提纲》（即《关于科技工作的几个问题》）的说明，得到邓小平的肯定。
1976年
被“四人帮”诬为“右倾翻案风”四名黑干将之一和“死不改悔的走资本主义道路的当权派”，备受打击迫害。
1977年
3月，任中共中央党校常务副校长。
7月15日，创办的中央党校内部刊物《理论动态》第一期出版。
8月12日至18日，参加中共第十一次代表大会，当选为中央委员。
10月7日，指导中央党校写的《把“四人帮”颠倒了的干部路线是非 纠正过来》一文在《人民日报》发表。
10月9日，出席中共中央党校开学典礼并讲话。
12月10日，被任命为中共中央组织部长。遵照党的实事求是，有错必 纠的原则，率领组织部全体同志，经过大量切实的调查研究，打开了平反冤假错案、落实党的干部政策的新局面
1978年
2月26日至3月5日，出席全国五届人大一次会议，当选为人大常委会委员。
5月10日，共青团第十次全国代表大会筹委会成立，受中共中央委托到会讲话。同日，中共中央党校内部刊物《理论动态》发表了经他修改定稿的文章：《实践是检验真理的唯一标准》。
5月11日，《光明日报》以本报特约评论员的署名发表了《实践是检验真理的唯一标准》。当天由新华社转发。
5月12日，《人民日报》、《解放军报》同时转载，引起了全国范围的“真理标准”问题的大讨论，为重新确立党的马克思主义思想路线作了理论准备。 8月10日，出席中央团校举行复校开学典礼。
9月20日，在全国信访工作会议上讲话，提出“凡是不实之词，凡是不正确的结论和处理，不管是什么时候、什么情况下搞的，不管是那一级组织、什么人定的批的，都要实事求是地改正过来。”
12月10日至15日，出席中共中央工作会议，并就彻底平反冤假错案、放手恢复老干部工作等问题，提出了重要意见。
12月18日至22日，出席中共十一届三中全会，被增选为中央政治局委员，当选为中央纪律检查委员会第三书记。十一届三中全会结束了党的工作连续两年徘徊不前的局面，开始全面、认真地纠正“文化大革命”中及其以前的“左”倾错误。
12月25日，中央政治局会议决定，任中共中央秘书长兼中共中央宣传 部部长，同时免去其中共中央组织部部长职务。12月16日至27日，第七次全国检察工作会议召开，到会作了重要讲话。
1979年
1月4日至22日，出席中共中央纪律检查委员会第一次全体会议，并在会上讲话。
1月7日至11日，主持召开各省、市、自治区党委宣传部长会议，并作重要讲话，提出全党工作重点转移后，党的宣传工作的根本任务。
1月18日，出席党的理论工作务虚会，并作了发言。
1月27日，出席首都各界3万人举行的盛大春节联欢晚会。
2月19日至24日，共青团中央召开团省、市、自治区委书记会议，到会作了重要讲话，指出团的干部要解放思想，转变作风，面向青年，面向基层，面向实际，到实践中找办法，在工作中长才干。
6月12日至17日，共青团中央召开12城市共青团负责人座谈会，到会与大家座谈，一起研究如何搞好青少年的政治思想工作。6月，任五届全国人民代表大会补选代表资格审查委员会主任。
7月30日，出席全国纪律检查工作会议，并就搞好党风问题作重要讲话，对做好纪律检查工作提出六点要求。
撰写文章及发表情况：
《邓小平与中国科技发展的春天》，《春天常在，丰碑永存——邓小平同志与中国科技事业》收录，科学技术文献出版社8月出版。
《在电子政务公文系统标准与技术高层论坛上的讲话》，《光明日报》9月3日刊登。
《企业家应该具备的七种素质》，《中华工商时报》9月3日刊登。
《政协委员建言立论的影响越来越大》，《人民日报》9月17日刊登。
《科学与艺术是相通的》，《中国文化报》9月28日刊登。
《科学研究的目标和环境》，《光明日报》10月8日刊登。
2005年（68岁）
出席中南海高层协商会，并递交书面建议。
出席并主持九三学社建社60周年纪念大会。
出席2005中国eBook产业年会并讲话。
接受中央台11套及中国京剧杂志社采访，对荀慧生诞辰105年、保存京剧戏曲资料发表看法；接受中科院及《科学时报》采访，就院士增选及问题发表看法，《科学时报》以“院士未必总是学术权威”为题予以报道。